Le relevé de frayères consiste à prospecter les cours d’eau à la recherche des zones de frai témoignant de la reproduction d’espèces piscicoles. Concernant les espèces que nous suivons, cette technique est surtout applicable à la truite de mer, au saumon et aux lamproies marine et fluviatile. En effet, les géniteurs de ces espèces retournent le substrat de la rivière pour y déposer leurs œufs qui nécessitent d’être enfouis sous les graviers pour se développer correctement.

Les comptages de nids de géniteurs post-reproduction ont été développés ces dernières années pour suivre les espèces afin d’améliorer les connaissances sur l’état des populations sur les bassins suivis, notamment en mettant en évidence les linéaires colonisés, les ouvrages infranchissables et le nombre de géniteurs s’étant reproduit. Cet indicateur trouve sa place en complément des autres suivis réalisés (STACOMI, Indices d’abondance...), en fournissant une donnée supplémentaire et complémentaire, par exemple un nombre de géniteurs non dénombrés à l’aval d’une STACOMI.